berenslab/uneye を動かしてみる (Python 3.6 を使用)

謝辞：作者に感謝します https://github.comberenslab/uneye

前準備

Python 3.6 のインストール，pip と setuptools の更新，Python 開発環境（JupyterLab, spyder, nteract）のインストール（Ubuntu 上）

Windows の場合

Python 3.6 のインストール
Python の URL: http://www.python.org/
インストール手順の詳細は：別ページで説明している．
隔離された Python 仮想環境の作成，pip と setuptools の更新，Python 開発環境（JupyterLab, spyder, nteract）のインストール（Ubuntu 上）
venv を用いて，隔離された Python 仮想環境を作り，設定を行う．
- 隔離された Python 仮想環境の名前: py36
- 使用するPythonのバージョン: 3.6
コマンドプロンプトを管理者として実行し，次のコマンドを実行．
```
py -3.6 -m venv C:\venv\py36
C:\venv\py36\Scripts\activate.bat
python -m pip install -U pip setuptools
python -m pip install -U jupyterlab jupyter jupyter-console jupytext nteract_on_jupyter spyder
```

Ubuntu の場合

次の手順により，システム Python とは別に，pyenv を用いて Pytnon 3.6 をインストールする．（システム Python の設定は変えたくないため）．

pyenv のインストールと設定

図などの入った詳しい説明は別ページ．

sudo apt -y install --no-install-recommends make build-essential libssl-dev zlib1g-dev libbz2-dev libreadline-dev libsqlite3-dev wget curl llvm libncurses5-dev xz-utils tk-dev libxml2-dev libxmlsec1-dev libffi-dev liblzma-dev
cd /tmp
curl https://pyenv.run | bash
echo 'export PYENV_ROOT="${HOME}/.pyenv"' >> ~/.bashrc
echo 'if [ -d "${PYENV_ROOT}" ]; then' >> ~/.bashrc
echo '    export PATH=${PYENV_ROOT}/bin:$PATH' >> ~/.bashrc
echo '    eval "$(pyenv init -)"' >> ~/.bashrc
echo '    eval "$(pyenv virtualenv-init -)"' >> ~/.bashrc
echo 'fi' >> ~/.bashrc
exec $SHELL -l

次のコマンドにより，pyenv を用いて Python
3.6.10 をインストール
```
pyenv install 3.6.10
```
Ubuntu では端末を開く．
pyenv の Python 3.6 の有効化． pip と setuptools の更新，Python 開発環境（JupyterLab, spyder, nteract）のインストール（Ubuntu 上）
端末で，次のコマンドを実行．
```
pyenv shell 3.6.10
python -m pip install -U pip setuptools
python -m pip install -U jupyterlab jupyter jupyter-console jupytext nteract_on_jupyter spyder
```

Git のインストール

Windows での Git のインストールは，別ページで説明している．
Ubuntu で git をインストールするには，端末で，次のコマンドを実行
```
sudo apt -y install git
```

berenslab/uneye のインストール

インストールのため Python 3.6 を使うように準備
- Windows の場合
  Windows では，コマンドプロンプトを管理者として実行．
  そして，隔離された Python 仮想環境を有効化
```
C:\venv\py36\Scripts\activate.bat
```
- Ubuntu の場合
  pyenv shell で Python を切り替え．
```
pyenv shell 3.6.10
```
berenslab/uneye のインストールディレクトリを空にしておく．
```
mkdir c:\pytools
cd c:\pytools
rmdir /s /q uneye
```

berenslab/uneye のインストール

https://github.com/berenslab/uneye で公開のもの．

git clone https://github.com/berenslab/uneye
cd uneye
python -m pip install -r requirements_wind.txt
python setup.py build
python setup.py install

使ってみる

Python 3.6 処理系の起動

Python 3.6 処理系として，Jupyter Qt Console を起動

Python プログラムを動かして，結果をビジュアルに見たい．

ここでは，Jupyter Qt Console を使っている．他の開発環境（spyder，PyCharm，PyScripter など）も便利である．

Windows の場合

隔離された Python 仮想環境を有効化してから起動．

C:\venv\py36\Scripts\activate.bat
jupyter qtconsole

Ubuntu の場合

pyenv shell で Python を切り替えてから起動．

pyenv shell 3.6.10
jupyter qtconsole

ここから先は，Jupyter Qt Console の画面で説明する．

動かしてみる

プログラムは，https://github.com/berenslab/uneye で公開のもの．

準備

cd C:\pytools\uneye

https://github.com/berenslab/uneye の UnEye.ipyrb を順に実行してみる．

本サイトは金子邦彦研究室のWebページです．サイトマップは，サイトマップのページをご覧下さい．本サイト内の検索は，サイト内検索のページをご利用下さい．

問い合わせ先：金子邦彦（かねこくにひこ）