berenslab/uneye を動かしてみる (Python 3.6 を使用)

謝辞：作者に感謝します https://github.comberenslab/uneye

前準備

Git のインストール

Windows での Git のインストールは，別ページで説明している．
Ubuntu で git をインストールするには，端末で，次のコマンドを実行
```
sudo apt -y update
sudo apt -y install git
```

Python 3.6 のインストール，pip と setuptools の更新，Python 開発環境のインストール

Windows の場合

Python 3.6 のインストール
Python の URL: http://www.python.org/
インストール手順の詳細は：別ページで説明している．
Windows では，Python 3.8 や 3.6 の共存は簡単．
pip と setuptools の更新，Python 開発環境，Python コンソール（Jupyter Qt Console, Jupyter ノートブック (Jupyter Notebook), Jupyter Lab, Nteract, spyder）のインストール（Windows 上）
コマンドプロンプトを管理者として実行し，次のコマンドを実行．
Python の使用は「py -3.6」で行う．

Windows での pip の実行では，コマンドプロンプトを管理者として実行することにする。
```
py -3.6 -m pip install -U pip setuptools
py -3.6 -m pip install -U jupyterlab jupyter jupyter-console jupytext nteract_on_jupyter spyder
```
Python の隔離された環境を使用したいときは，次のような手順で， venv を用いて，Python の隔離された環境を作る．
- Python の隔離された環境の名前: py36
- 使用するPython のバージョン: 3.6
- Python の隔離された環境を置くディレクトリ: C:\venv\py36
コマンドプロンプトを管理者として実行し，次のコマンドを実行．
Python の使用は「C:\venv\py36\Scripts\activate.bat」の後，「python」で行う．
```
py -3.6 -m pip install -U pip setuptools
py -3.6 -m venv --system-site-packages C:\venv\py36
C:\venv\py36\Scripts\activate.bat
python -m pip install -U pip setuptools jupyterlab jupyter jupyter-console jupytext nteract_on_jupyter spyder
```

Ubuntu の場合

次の手順により，システム Python とは別に，pyenv を用いて Pytnon 3.6 をインストールする．（システム Python の設定は変えたくないため）．

pyenv のインストール

Ubuntu での pyenv のインストール手順の詳細説明: 別ページで説明している．

rm -rf ~/.pyenv
cd /tmp
git clone https://github.com/pyenv/pyenv.git ~/.pyenv
cd ~/.pyenv
git pull
src/configure 
make -C src
echo 'export PYENV_ROOT="${HOME}/.pyenv"' >> ~/.profile
echo 'if [ -d "${PYENV_ROOT}" ]; then' >> ~/.profile
echo '    export PATH=${PYENV_ROOT}/bin:$PATH' >> ~/.profile
echo '    eval "$(pyenv init --path)"' >> ~/.profile
echo 'fi' >> ~/.profile
echo -e 'if command -v pyenv 1>/dev/null 2>&1; then\n  eval "$(pyenv init -)"\nfi' >> ~/.profile
exec $SHELL -l
source ~/.profile
sudo apt -y install --no-install-recommends make build-essential libssl-dev zlib1g-dev libbz2-dev libreadline-dev libsqlite3-dev wget curl llvm libncurses5-dev xz-utils tk-dev libxml2-dev libxmlsec1-dev libffi-dev liblzma-dev

インストールできる Python 3.6 のバージョンの確認
```
pyenv rehash 
pyenv install -l | grep 3.6
```
システム Python とは別に Python 3.6 をインストール（pyenv を使用）
```
pyenv install 3.6.12
```
pyenv の Python 3.6 の有効化．
端末で，次のコマンドを実行．
```
pyenv shell 3.6.12
```
Python の切り替えは次のようなコマンドで行う．
- pyenv shell system
- pyenv shell 3.6.12
デフォルトで pyenv 配下の python 3.6.12 を使いたいときは，次のように設定する
```
echo 'pyenv shell 3.6.12' >> ~/.bashrc
exec $SHELL -l
```
pip と setuptools の更新，Python 開発環境（JupyterLab, spyder）のインストール（Ubuntu 上）
インストールするには，端末で，次のコマンドを実行．
```
python -m pip install -U pip setuptools jupyterlab jupyter jupyter-console jupytext nteract_on_jupyter spyder
```
Python の隔離された環境を作成したいときは，次のような手順で， venv を用いて，Python の隔離された環境を作る．
- Python の隔離された環境の名前: py36
- 使用するPython のバージョン: 3.6
- Python の隔離された環境を置くディレクトリ: ~/py36
端末を開き，「pyenv shell 3.6.12」を実行して，pyenv の Python 3.6 を有効化した後，次のコマンドを実行．
```
python -m pip install -U pip setuptools
python -m venv --system-site-packages ~/py36
source ~/py36/bin/activate
python -m pip install -U pip setuptools jupyterlab jupyter jupyter-console jupytext nteract_on_jupyter spyder
```

berenslab/uneye のインストール

Python 3.6 を起動するコマンドを確認しておくこと．

Windows の場合: 「py -3.6」
Windows で Python の隔離された環境 py36 を使う場合: 「C:\venv\py36\Scripts\activate.bat」の後，「python」
Ubuntu の場合: 「pyenv shell 3.6.12」の後，「python」
Ubuntu で Python の隔離された環境 py36 を使う場合: 「source ~/py36/bin/activate」の後，「python」

インストールのため Python 3.6 を使うように準備
- Windows の場合
  Windows では，コマンドプロンプトを管理者として実行する．
  
  Python の隔離された環境を使用するときは，次のようなコマンドで有効化する．
```
C:\venv\py36\Scripts\activate.bat
```
  Python の使用は，Python の隔離された環境の有効化の後，「python」で行う． Windows で，Python の隔離された環境を使用しないときは，「python」ではなく「py -3.6」を使う．
- Ubuntu の場合
  端末で，次のコマンドを実行．
```
pyenv shell 3.6.12
```
  Python の隔離された環境を使用するときは，「pyenv shell 3.6.12」は実行しないで，次のようなコマンドで Python の隔離された環境を有効化する．
```
source ~/py36/bin/activate
```
berenslab/uneye のインストールディレクトリを空にしておく．
Window の場合は次のように操作する．
```
mkdir c:\pytools
cd c:\pytools
rmdir /s /q uneye
```

berenslab/uneye のインストール

https://github.com/berenslab/uneye で公開のもの．

git clone https://github.com/berenslab/uneye
cd uneye
python -m pip install -r requirements_wind.txt
python setup.py build
python setup.py install

使ってみる

Python 3.6 処理系の起動

Python 3.6 処理系として，Jupyter Qt Console を起動

Python プログラムを動かして，結果をビジュアルに見たい．

ここでは，Jupyter Qt Console を使っている．他の開発環境（Spyder，PyCharm，PyScripter など）も便利である．

Windows の場合

Python の隔離された環境を有効化してから起動．

C:\venv\py36\Scripts\activate.bat
jupyter qtconsole

Ubuntu の場合

pyenv shell で Python を切り替えてから起動．

pyenv shell 3.6.12
jupyter qtconsole

ここから先は，Jupyter Qt Console の画面で説明する．

動かしてみる

プログラムは，https://github.com/berenslab/uneye で公開のもの．

準備

cd c:\pytools\uneye

https://github.com/berenslab/uneye の UnEye.ipyrb を順に実行してみる．

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